MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013851	CCG	2	6	2981396	2981401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_013851	ACGG	2	8	2981427	2981434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_013851	GAC	2	6	2981441	2981446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_013851	CCG	2	6	2981523	2981528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_013851	CTG	2	6	2990232	2990237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_013851	CCA	2	6	2990365	2990370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_013851	TCCAG	2	10	2990463	2990472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5508	NC_013851	CGAGC	2	10	2990519	2990528	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5509	NC_013851	CGG	2	6	2990565	2990570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_013851	GCC	2	6	2990586	2990591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_013851	CG	3	6	2990626	2990631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_013851	GCG	2	6	2993196	2993201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_013851	GC	4	8	2993218	2993225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_013851	TCC	2	6	2993232	2993237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_013851	GAAC	2	8	2993249	2993256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_013851	GGCG	2	8	2994757	2994764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_013851	CCT	2	6	2994843	2994848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_013851	GC	3	6	2995073	2995078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_013851	CAT	2	6	2995108	2995113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_013851	GC	3	6	2995135	2995140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_013851	ACA	2	6	2995141	2995146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_013851	ACCA	2	8	3008863	3008870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_013851	GCTC	2	8	3016985	3016992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_013851	GATG	2	8	3019457	3019464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013851	GTCG	2	8	3019481	3019488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_013851	CG	3	6	3019623	3019628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_013851	GCT	2	6	3021980	3021985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_013851	CG	3	6	3022000	3022005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_013851	GCT	2	6	3022023	3022028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_013851	GTT	2	6	3022037	3022042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013851	TTG	2	6	3022052	3022057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013851	CGC	2	6	3022065	3022070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_013851	CTAGC	2	10	3022091	3022100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5534	NC_013851	CT	3	6	3025187	3025192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_013851	CG	3	6	3025576	3025581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_013851	GA	3	6	3028619	3028624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_013851	GAAA	2	8	3028656	3028663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_013851	GATC	2	8	3030312	3030319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_013851	TGG	2	6	3031986	3031991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013851	CGG	2	6	3031993	3031998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_013851	CAA	2	6	3032086	3032091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_013851	CAA	2	6	3032104	3032109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_013851	TGT	2	6	3032166	3032171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_013851	ATCGAT	2	12	3032207	3032218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5545	NC_013851	TCG	2	6	3032949	3032954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_013851	TCAG	2	8	3032958	3032965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_013851	GCG	2	6	3032972	3032977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_013851	CCG	2	6	3032988	3032993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_013851	GGA	2	6	3037549	3037554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_013851	GCC	2	6	3037848	3037853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_013851	ATG	2	6	3037892	3037897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_013851	CCGA	2	8	3037930	3037937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_013851	CA	3	6	3037938	3037943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_013851	CTT	2	6	3038645	3038650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_013851	AG	3	6	3039698	3039703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_013851	CCG	2	6	3039759	3039764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5558	NC_013851	CG	3	6	3043597	3043602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_013851	GC	3	6	3043633	3043638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_013851	TGT	2	6	3043655	3043660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_013851	CTC	2	6	3044283	3044288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_013851	GGC	2	6	3044298	3044303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_013851	GCG	2	6	3044315	3044320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_013851	CG	3	6	3044319	3044324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_013851	CCG	2	6	3044338	3044343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_013851	GGA	2	6	3044935	3044940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_013851	GGC	2	6	3044991	3044996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_013851	GCG	2	6	3045025	3045030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_013851	TCGGT	2	10	3045033	3045042	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5570	NC_013851	GACC	2	8	3045050	3045057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_013851	GGACT	2	10	3046887	3046896	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_013851	GCG	2	6	3046903	3046908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_013851	TA	3	6	3047012	3047017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_013851	CGG	2	6	3047361	3047366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_013851	TCG	2	6	3047393	3047398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_013851	GCG	2	6	3047401	3047406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_013851	GACA	2	8	3047450	3047457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5584	NC_013851	GAA	2	6	3047531	3047536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_013851	G	6	6	3058040	3058045	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_013851	ATCT	2	8	3058605	3058612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_013851	GC	3	6	3059873	3059878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_013851	TCCC	2	8	3060521	3060528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5598	NC_013851	TGCC	2	8	3061045	3061052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_013851	GC	3	6	3061056	3061061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_013851	CG	3	6	3061557	3061562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_013851	GGA	2	6	3061636	3061641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_013851	GCG	2	6	3062141	3062146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_013851	GA	3	6	3065749	3065754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_013851	G	7	7	3065757	3065763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5607	NC_013851	CGG	2	6	3065834	3065839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_013851	TGT	2	6	3067315	3067320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_013851	CAT	2	6	3067325	3067330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5611	NC_013851	TCG	2	6	3067719	3067724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_013851	CG	3	6	3067737	3067742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_013851	GCAA	2	8	3067819	3067826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_013851	CGC	2	6	3074243	3074248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_013851	AGC	2	6	3074253	3074258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5618	NC_013851	CGCGC	2	10	3074288	3074297	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5619	NC_013851	GCCG	2	8	3078936	3078943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_013851	AC	3	6	3082054	3082059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5624	NC_013851	TCC	3	9	3083245	3083253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_013851	TCG	2	6	3083295	3083300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_013851	CCCA	2	8	3083322	3083329	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5627	NC_013851	GTC	2	6	3088872	3088877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_013851	AGG	2	6	3088884	3088889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_013851	TCGC	2	8	3090429	3090436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_013851	TC	3	6	3090460	3090465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_013851	GC	3	6	3093505	3093510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_013851	CAT	2	6	3093601	3093606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_013851	CGC	2	6	3093642	3093647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5634	NC_013851	GC	4	8	3095107	3095114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5635	NC_013851	CGT	2	6	3095124	3095129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_013851	CACG	2	8	3095208	3095215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5637	NC_013851	CGACG	2	10	3095224	3095233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5638	NC_013851	GC	3	6	3096743	3096748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5639	NC_013851	CG	3	6	3096832	3096837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5640	NC_013851	CGT	2	6	3096949	3096954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5645	NC_013851	CAT	2	6	3101518	3101523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5649	NC_013851	CGGT	2	8	3103270	3103277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5650	NC_013851	TGTCG	2	10	3105422	3105431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5654	NC_013851	GCT	2	6	3110245	3110250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5667	NC_013851	TCG	2	6	3112830	3112835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5757	NC_013851	TGG	2	6	3156226	3156231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5759	NC_013851	CATC	2	8	3156394	3156401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5760	NC_013851	GACC	2	8	3156408	3156415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5761	NC_013851	CG	3	6	3157928	3157933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5762	NC_013851	GA	3	6	3158629	3158634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5763	NC_013851	ACCA	2	8	3160129	3160136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5765	NC_013851	AGA	2	6	3161392	3161397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5769	NC_013851	GGCGG	2	10	3162578	3162587	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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5781	NC_013851	GC	3	6	3172203	3172208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5782	NC_013851	CCCG	2	8	3172242	3172249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5783	NC_013851	TAT	2	6	3173651	3173656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5792	NC_013851	ATGGG	2	10	3176898	3176907	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5793	NC_013851	A	6	6	3178811	3178816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5799	NC_013851	CCGT	2	8	3180288	3180295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5894	NC_013851	T	6	6	3255063	3255068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5897	NC_013851	CTG	2	6	3262121	3262126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5898	NC_013851	GAAC	2	8	3263739	3263746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5899	NC_013851	ACCG	2	8	3263758	3263765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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